Merbはコマンドラインから-c 3のように指定する事で、 クラスターとして起動出来ますが、これを設定ファイルの 中から行う場合には、以下のように書けば良いようです。

config/init.rb

   1  Merb::Config.use do |c|
   2   ...
   3    c[:port] = 4001
   4    c[:cluster] = 2
   5  end

あとは、普通にmerbコマンドで起動するだけです。 config/environments/production.rbなどで設定しても良いですね。