ここのレビューがためになりました。ので抜粋。
http://highscalability.com/google-appengine-second-look

Developer Forum抜粋訳

• データベースのエクスポート機能はなし。自前で用意する必要あり。
• limitに気をつけろ
  • 1MB upload limit
  • 1000 database return limit
  • Google limits your CPU usage
• フルテキスト検索はサポート対象外
• SessionはGoogleのを使え：djangoのauth, sessionは使えない
• 遅い：It takes GAE almost 3 seconds to save 50 of dummy records (consisting of just 2 text fields).

以下、自分用メモ。

GAEでの注意

• MySQLとBigTableは全然違う観点で作られている
  ちょっとのデータをめっちゃくちゃ早くするというものがゴールでなくて、多くのデータを処理し、分散させるというゴールにもとづいてデザインされている。
• web appの開発ノウハウは全然役に立たない(Sessionがないとか、JOINがないとかが大きい理由？)
• AWSのノウハウはGAEでは全然役に立たない(GAEはvm。モデルが違う)

早くするコツみたいなもの：遅いのは使い方が良くないから

例えばavg()、データをInsertする時に計算しておいて、表示するだけのほうがよい。
MYSQLだとアクセスがあったときにJOINして計算するのが普通だろうが、GAEではデータは分散されて保存されるので(+JOINがない)、そのたび計算するのだと遅くなる。
Insert時に計算はすべて終わらせて、あとはSelectだけということか。

Refs

http://hiroshiykw.blogspot.com/2008/04/google-app-engine_10.html