GAE/Jにはファイル数制限（1000まで）があるので、なるべく不要なファイルは減らしたいのが人情というものです。
ということで、unpackしたgemsから不要なファイルを掃除するために、以下のようなスクリプトを使用しています。

script/strip_gems

ruby>>
#!/usr/bin/env ruby

Dir['gems/gems/'].each do |dir|
%w(
Generaters TODO README. README
spec// test// examples// tasks//
tutorial// demo//
CHANGES CHANGES.txt CHANGELOG
LICENSE MIT-LICENSE Rakefile CONTRIBUTORS
Manifest.txt History.txt install.rb setup.rb
).each do |pattern|
Dir[File.join(dir, pattern)].each do |path|
command = "rm -rf #{path}"
puts command
system command
end
end
end
<<--

Gemの中に含まれているファイルには制約が無いので、
簡単なパターンで全てを掃除するのは難しいですね。