macに移行して、日本語が入っているrbファイルをemacsで編集したら、下記のようなコメント行が1行目に入るようになりました。

rails>>

-- coding: utf-8 --

<<--

半日くらいかかって(遅っ)やっとruby-modeで入れていることが判明。Ruby1.9対応の一環ということがわかりました。

Ruby 1.9で実行するスクリプトに日本語を書く場合、スクリプトの文字コードを表すmagic commentは事実上必須となる。
http://d.hatena.ne.jp/rubikitch/20080307/magiccomment

ただ日本語が入っていないrbファイルはそういうmagickコメントが入らないとか、rhtmlはどうなるのかとか対応が不明なのもあるので、magickコメントを入れないようにしました。

###magickコメント挿入関数を無効にする
shell>>
;;.emacsなどで
;; from http://d.hatena.ne.jp/akm/20080605#1212644489
(require 'ruby-mode)
(defun ruby-mode-set-encoding () ())
<<--
from http://d.hatena.ne.jp/akm/20080605#1212644489

また下記の方法もあったのですが、初期化のタイミング？かうまく動きませんでした。

shell>>
;; from http://masao.jpn.org/etc/.emacs.el
;; codingの自動挿入をやめる
;(remove-hook 'before-save-hook 'ruby-mode-set-encoding)
<<--
from http://masao.jpn.org/etc/.emacs.el