gem push によって、
gem の公開が大変簡単になりました。
しかし、敷居の低さは油断に繋がるもので、
近い将来、誰もが一度は秘匿性のあるファイルを誤って公開してしまい、
パニックになることでしょう。

今回、皆さんを出し抜く形になってしまい甚だ恐縮ではございますが、
一足先に体験させて頂きましたので、
その対処法を報告致します。

手順

1. gem yank
2. support staff への報告

1. gem yank

gem の新機能である yank コマンドを利用すると、
指定したバージョンの gem の公開を停止することができます。
例えば、foo-0.0.1 gem の場合、以下を実行します。

shell>>
% gem yank foo -v0.0.1
<<--

この機能は rubygems1.3.6 にはまだ含まれて居ませんので、
"Unknown command yank" と言われた場合には、
以下のコマンドで gem を最新のものにアップグレードする必要があります。(1.3.7以降で、gemcutterも0.5.1以降であれば不要なはずです)

shell>>
gem update --system
gem install gemcutter
<<--

2. support staff への報告

これで、gemcutter の index からは削除され、
gem search および install の対象からは除外されたのですが、
ホームページ上からは依然としてダウンロードが可能な状態になっています。
完全に削除しない理由は、

• その gem に依存関係を持つ gem が存在し得る
• 重要な gem (例えば rails) が突然なくなると困る

というポリシーからのようです。
でも、
「パスワードみたいに本当に致命的な場合は、
個別に判断するのでとりあえず連絡下さい」
という方針のようなので、
以下の問い合わせフォームから削除を嘆願します。

http://help.rubygems.org/discussion/new

これは基本的に公開BTSなので、下のほうにある

[x] This is a private discussion, don't let the public see

を忘れずにチェックして、private なメッセージにして投稿しましょう。
これで数日中には完全に削除されるはずですので、
support staff に感謝の気持ちを伝えて作業完了です。

[おまけ] unyank

yank を取り消す(undo)機能も存在しています。

shell>>
% gem yank foo -v0.0.1 --undo
<<--

この yank / undo の一連の操作を覚えておくと、
「もしかしてセキュリティーホールがある？」
「新バージョンでエンバグしてる？」
なんて時には速攻で yank して、
「やっぱ気のせい」
という場合は undo で戻せるので、とても便利です。

参考

Removing a published RubyGem