rvmを使ってcapistranoでアプリケーションごとに異なるrubyのバージョンを利用するには、Capfileの先頭に以下のような記述をすればok

   1  $:.unshift(File.expand_path('./lib', ENV['rvm_path']))
   2  require "rvm/capistrano"
   3  set :rvm_ruby_string, '1.9.3'
   4  set :rvm_type,    :user

ついでに ROOT に .rvmrc を追加して中身に

   1  rvm 1.9.3

のようにしておけば cd したときにrubyのバージョンが切り替わって便利です。