古いRailsアプリをBundler仕様にする場合、

ruby>>
config.gem "foo",
:version => "0.0.1",
:lib => "bar",
:source => "http://gems.github.com"
<<--

と等価なGemfileの記述方法は

ruby>>
source "http://gems.github.com"
gem "foo", "0.0.1", :require => "bar"
<<--

で良いようです。バージョン指定をしない場合は第二引数を省略可。