GitHub上で公開されているgemは、GEM_NAMEにユーザIDがプレフィックスとしてついてしまうので、以下のようにdependency.rbを記述する必要があります。

   1  dependency "genki-merb_babel", :require_as => 'merb_babel'

Railsのconfig.gemの場合の:libオプションに似ていますね。