GAE/Jにはファイル数制限（1000まで）があるので、なるべく不要なファイルは減らしたいのが人情というものです。 ということで、unpackしたgemsから不要なファイルを掃除するために、以下のようなスクリプトを使用しています。

script/strip_gems

   1  #!/usr/bin/env ruby
   2    
   3  Dir['gems/gems/*'].each do |dir|
   4    %w(
   5      Generaters TODO README.* README
   6      spec/**/* test/**/* examples/**/* tasks/**/*
   7      tutorial/**/* demo/**/*
   8      CHANGES CHANGES.txt CHANGELOG
   9      LICENSE MIT-LICENSE Rakefile CONTRIBUTORS
  10      Manifest.txt History.txt install.rb setup.rb
  11    ).each do |pattern|
  12      Dir[File.join(dir, pattern)].each do |path|
  13        command = "rm -rf #{path}"
  14        puts command 
  15        system command
  16      end
  17    end
  18  end

Gemの中に含まれているファイルには制約が無いので、 簡単なパターンで全てを掃除するのは難しいですね。