Merb/DataMapper/CouchDBの環境で rspec を使う場合には、 spec_helper.rb で以下のように設定すると良いようです。

   1    config.before(:all) do
   2      DataMapper::AutoMigrator.auto_migrate(nil,
   3        *(DataMapper::Resource.descendants - [Merb::DataMapperSessionStore]))
   4    end

セッションストアを使っている場合は、 Merb::DataMapperSessionStore用のrepositoryを 別途指定すると良いと思います。